（1）Vitek-AMS 全自动鉴定系统
①工作原理
采用光电技术、电脑技术和八进位制数码鉴定相结合。每个鉴定卡内含有30项生化反应，每三项为一组，各确立阳性反应值分别为1，2，4。如三项全部为阳性，其组值为7；如1，2项阳性为3；如1，3项阳性为5；依次类推。30项生化反应可获取10位数和生物数码。读数器每隔30min 对每一试卡读数一次，对各反应孔底物进行光扫描，动态观察反应变化，一旦试卡内终点指示孔到达临界值，指示反应完成，系统将后一次判读的结果所得生物数码与菌种库标准菌生物模型相比较，经矩阵分析得出鉴定值和鉴定结果，并自动打印报告。
②仪器和试剂 Vitek--AMS 系统
包括以下几个部件：充填机/封口机、读取器/恒温器、电脑主机及打印机组成。另需配置：比浊器；检测卡片（由聚苯乙烯塑料制成，大小约为91mm×57mm×3.5mm）。
③操作程序
a.制备菌悬液从平板上挑取纯培养物制成菌悬液用光电比浊仪比浊，配制成相当的浊度。
b.菌液接种和封闭由系统充填机/封口机自动进行。
c.培养/读数由读取器/恒温器自动进行。
d.打印结果报告检测完成后，自动打印报告。
（2）其他全自动鉴定系统
除了 Vitek-AMS 外，目前常见的全自动鉴定系统还有 MicroScan 自动鉴定系统、Sensititre 全自动微生物鉴定/药敏测试系统，这两种全自动鉴定系统，在光电比色的基础上采用了荧光分析技术，使鉴定速度更快、更准确。
（3）半自动微生物鉴定系统
半自动鉴定系统，是由微量生化检测系统发展而来。其原理也是将各种不同的生化反应组成专一鉴定试剂条（或板）。经培养后用光电读数器自动读数，将数据自动传送到计算机，由计算机分析处理，并打印结果分析报告。每一系统都有其分析特点，用户可根据需要选用。